CoronaChroniken: die PCR und der CT-Faktor

Liebe Maskierte,

es tut sich immer mehr. Selbst die Tagesschau berichtet jetzt schon differenzierter über Probleme mit dem PCR Test.

CoronaChroniken: die PCR und der CT-Faktor

In dem Artikel „Houston, wir haben ein Problem!“ habe ich Euch die Berechnung der Korrektheit des Testergebnisses näher gebracht. Damit gibt es eine quantifizierbare Aussage zu den falschen positiven Ergebnissen eines PCR Tests. Das alleine sagt aber noch nichts über das Testergebnis aus. Ginge es bei einem Test nur um einen Block 1x1x1mm der komplett mit Viren angefüllt wäre, es wäre ein leichtes direkt die VirenRNA nachzuweisen. Wie Ihr vermutlich im Fernsehen oder auf Fotos gesehen habt, nimmt man aber aus rein praktischen Gründen eine Speichelprobe.

Die Speichelprobe muß im Labor erst einmal wieder vom Probennehmer getrennt werden, dazu weicht man das normalerweise ein. Es dürfte einleuchten, daß sich dabei die Probenmasse verdünnt. Damit man ein klares Ergebnis bekommen, wird im nächsten Schritt die RNA vermehrt, bis man durch Erfahrung annehmen kann, daß jetzt genug RNA für einen Nachweis vorhanden sein müßte, wenn in der Ausgangsprobe die gesuchte RNA enthalten war. Die Anzahl der Vermehrungsdurchläufe ist der CT-Faktor. Der liegt ungefähr bei 15.

Kleines Intermezzo der Mathematik:

Wir haben ja am Anfang gelernt, daß so eine ungebremst stattfindende Epidemie nicht linear stattfindet, sondern das die Infiziertenzahlen einer Expotenialfunktion folgen. Eine Person steckt eine andere an ( 1 + 1 = 2 ), jetzt haben wir zwei Personen die auch zwei Personen anstecken ( 2 + 2 = 4 ) , ( 4 + 4 = 8 ), (8 +8 = 16 ) oder ums kurz zu machen 2^n, wenn eine Person drei ansteckt, also 3^n, dann geht das alles noch viel schneller rauf:

Datum2^n3^n100 Infektionen am Tag
01.01.20110
02.01.2023100
03.01.2049200
04.01.20827300
05.01.201681400
06.01.2032243500
07.01.2064729600
08.01.201282187700
09.01.202566561800
10.01.2051219683900
11.01.201024590491000
12.01.2020481771471100
13.01.2040965314411200
14.01.20819215943231300
15.01.201638447829691400
16.01.2032768143489071500
17.01.2065536430467211600
18.01.201310721291401631700
19.01.202621443874204891800
20.01.2052428811622614671900
21.01.20104857634867844012000
22.01.202097152104603532032100
23.01.204194304313810596092200
24.01.208388608941431788272300
25.01.20167772162824295364812400
26.01.20335544328472886094432500
27.01.206710886425418658283292600
28.01.2013421772876255974849872700
29.01.20268435456228767924549612800
30.01.20536870912686303773648832900
31.01.2010737418242058911320946493000
01.02.2021474836486176733962839473100
02.02.20429496729618530201888518403200
03.02.20858993459255590605665555203300

Selbst wenn man eine lineare Infektion von 100 Neuinfektionen am Tag ansetzen würde, hätte schon nach spätestens 12 Tagen die langsamste Expotentialfunktion die Nase vorn. Könnt Ihr Euch nicht vorstellen, kein Problem:

So funktioniert das auch bei RNA Vermehrung: aus einer RNA werden 2, dann 4, 8, 16, 32, 64, 128 usw.  Ein CT Faktor von 15 entspricht also einem Vermehrungsfaktor von 32.768x mehr RNA, als in der Probe war. Wenn man jetzt einen PCR Test macht, könnte der anschlagen oder nicht. Wenn ich aber unbedingt ein positives Ergebnis haben will, dann wird die RNA noch 15x vermehrt ( CT=30 ), was der 536.870.912x Menge der Ausgangsmenge entspricht.  Hatte ich am Anfang auch nur 1 Stück RNA, habe ich nach 30 Durchläufen praktisch einen todsicheren Treffer für die PCR produziert.

Das Interpreationsdilemma

Jetzt gibts nur ein Problem: Der (möglicherweise) eine Virus in der Probe des Patienten führt niemals zu einer Infektion einer anderen Person, die Virusgrundlast die dafür bei einer Kontaminierung nötig ist, ist deutlich höher. So ein vagabundierendes RNA-Fragment wird einfach nebenbei vom Immunsystem erledigt bzw. dringt gar nicht erst ein, weil die Hürden dafür zu hoch sind, trotzdem hatte ich jetzt einen positiven Test und muß in Quarantäne? Ja, genau das blüht Euch, wenn das Testergebnis nicht vernünftig bewertet wird. Und der Faktor 30 wird in einigen Laboren sogar noch bis 37 oder 40 hochgetrieben.

Einige Labore teilen den CT Faktor für den positiven Test den Gesundheitsämtern gar nicht mit, die haben also gar ḱeine andere Wahl als eine Quarantäne zu verhängen, bis ein zweites Ergebnis da ist. Einige tun es und dann kann das Gesundheitsamt entscheiden und tut dies auch sinnvollerweise.

Im Sinne alle Betroffenen müßte der CT Faktor des Tests mit an das Gesundheitsamt übermittelt werden. Als Resultat hätten wir spontan wieder viel weniger positive Fälle, weil ein positiver CT=40 Test für die Tonne ist, meint sogar Herr Drosten 😉 Die eine RNA aus dem Beispiel oben, könnte sich die Probe schon beim Kontakt mit der Luft einfangen. PCR Tests sind also aus mehreren Gründen nicht ganz ohne und sollten nur von echten Fachleuten und nicht von Laien interpretiert werden.

CoronaChroniken: Graphen als SVG Bild

Liebe Maskierte,

außer dem neuerlichen Versagen der Behörden in Bayern beim Verteilen von Testergebnissen und dem Verschwinden von 250 Testergebnissen in Hamburg, gibt es an der Coronafront nicht neues.

CoronaChroniken: Graphen als SVG Bild

Da es nichts zu berichten gab, was man nicht schon geahnt hätte, habe ich mir mal die Zeit genommen, die alten RKI Daten auf den neuesten Stand zu bringen. Dabei sind einige nicht unerhebliche Veränderungen eingetreten, weswegen es sinnvoll wäre mal alle Graphen neu zu erzeugen. Beim Thema „neu erzeugen“ möchte ich auch nicht mehr mit Kria die Graphen aus einem Screenshot rauscroppen, sondern fertige Bilder haben.

Da hat sich jetzt LibreOffice angeboten, denn dies verfügt über einen Graphenexport der die Tabellen als SVG abspeichert. Dies hat den Vorteil, daß die resultierenden Grafiken nicht mehr manuell bearbeitet werden müssen und vor allem sind diese deutlich keiner als PNG oder JPGs. Wer hier im Blog nicht nur die Coronabeiträge liest, wird den hier kennen: Updaten geht nur, wenn man Platz hat

Jetzt kann WordPress als Blog die SVG Grafiken nicht automatisch verarbeiten, weil dies eine Sicherheitsproblem darstellt. Wer es wie ich doch nutzen möchte, muß sich ein SVG Plugin installieren, daß die textbasierten XML Anweisungen für die Darstellung erst noch filtert um Schadcode zu entfernen. In der Vergangenheit waren hier verschiedenste Angriffe auf den Browser und PC den Besuchers möglich. Bei selbst generierten SVGs ist die Gefahr zwar nicht vorhanden, aber WP weiß ja nicht, wo diese hergekommen sind 😉

Nun zu den Graphen

Der Vorteil der neuen Graphen ist, daß sie sich skalieren lassen. Sie sehen also auf jedem Bildschirm optimal aus.

Auch können die Grafiken jetzt beliebig vergrößert werden um Details zu erkennen, die vorher im Pixelbrei verloren gegangen sind.

Jetzt gibt es leider doch noch etwas zu berichten, denn in Hannover ist jetzt ein Kind(9) von einer Privatschule geflogen, weil es ein Attest zur Befreiung von der Maskenpflicht hatte und dies auch durchsetzen wollte. Das Kind ist jetzt an einer öffentlichen Schule ohne Probleme untergebracht worden.

Traurige Zeiten sind das, wenn man den zweifelhaften Nutzen einer Alltagsmaske bedenkt, aber die realen Nebeneffekte kennt. Ich rede hier nicht von noch nicht erwiesenen Rückkopplungen wie Pilzbefall, sondern von Druckschmerzen, Hautirritationen und Unwohlsein. Diese sind real greifbar, wie auch die Berufsmaskenträger im Krankenhaus bestätigen können. „Mal“ eine Gesichtsmaske tragen geht ja noch, aber dauerhaft ist das eine Belastung.

Wer Munition gegen Mund-Nase-Bedeckungen braucht, hier im Blog findet Ihr jede Menge Material, daß Ihr den Mitläufern um die Ohren hauen könnt 😉 Einfach hier klicken:

https://marius.bloggt-in-braunschweig.de/search/Masken

Ich schlage vor die Grafik mit den Vergleich Neuinfizierte / Tote zu nehmen, dann die Leute mal einzeichnen zu lassen, wann welche Maßnahme: (Lockdown 22.3. / Maskenpflicht 24.4.) war und Ihnen dann die Schwankungensgrafik unter die Nase zu halten. Die meisten Maskenfans liegen voll daneben, was die Maßnahmen betrifft. Da sie dann merken, daß sie eigentlich nichts wissen, fangen sie an zu denken… hoffentlich.

Ceterum censeo Personae esse delenda!

 

CoronaChroniken: Es tut sich was

Liebe Maskierte,

die Frage, wieso es hauptsächlich Ältere Menschen mit Vorerkrankungen in der Risikogruppe gibt, könnte geklärt worden sein.

CoronaChroniken: Es tut sich was

Wie aus einer Studie der Charité in Berlin hervorgeht, gibt es im Blut von Risikopatienten viel mehr T-Helferzellen, als im Blut von Patienten deren Verlauf mild ist. Das ist ein krasser Widerspruch zur Aufgabe der T-Helferzellen, denn die sind für die Immunantwort verantwortlich (u.a.). Wieso verlaufen die Erkrankungen also schwerer als die von Menschen, wo viel weniger T-Helferzellen vorhanden sind? Das scheint an einer Immunantwortbremse zu liegen, denn im Blut der Patienten ist vergleichsweise wenig Interferon gamma. Das Interferon gamma löst andere Prozesse der Immunabwehr aus, ist es nicht da, fehlt diese Antwort. Die Charité geht davon aus, daß sich diese Erkenntnis als Therapieansatz nutzen läßt, weitere Studien sind nötig.

Vermutung

Wenn ich eine Vermutung äußern müßte, würde ich meinen, daß auch bei anderen Infektionskrankheiten dieses Phänomen bei schweren Verläufen beobachtet werden kann und sich die Behandlung universell eignen wird, schwere Verläufe bei Infektionen zu behandeln.

In weiteren Nachrichten

Gesundheitsminister Jens Spahn äußerte, bevor er auf seiner jüngsten Wahlkampfveranstaltung in Bochum ausgebuht wurde, um es freundlich auszudrücken, daß ein nochmaliges Schließen von Einzelhandelsgeschäften, Friseuren etc. nicht in Frage kommt, weil es „unangemessen“ war. Ebenso wird es keine Kontaktverbote in Alten- und Pflegeheimen mehr geben. Spät, aber immerhin, ein Sinneswandel. Auf die nutzlose Maske möchte er nicht verzichten. Da bekommen wir Ihn auch noch zu 😉

Medizinisch auffällig, aber nur bedingt im Bezug zu Corona relevant, äußerte sich Herr Trumph dahingehend, daß Joe Biden und die Protestbewegung BLM von Menschen aus der „Schattenwelt“, die im Verborgenen agierten, gesteuert( und finanziert). Das war dann selbst Trumps Haus- und Hofsender Fox News zu viel: „Das klingt sehr nach einer Verschwörungstheorie“, entgegnete Fox-Moderatorin Laura Ingraham.

Apple und Google

Ähnlich schlimm, weil nicht überprüfbar, ist diese Meldung:

Apple und Google überraschen – keine App mehr für Coronakontaktverfolgung nötig

Man bräuchte dann keine App mehr, weil es im OS ist. Was aber auch bedeutet, daß derjenige, der das OS beherrscht festlegt, ob dieses Teil aktiv ist, oder nicht. Da weder das Google Android, noch das Apple iOS schon gar nicht, nicht vollständig OpenSource ist, müßte man hier wieder jemandem vertrauen, dessen Geschäftsmodell das Verkaufen von Daten ist, und die Handyhersteller dürfen wir nicht vergessen, die da auch dran rumfummeln können und werden. Das treibt einen eigentlich immer schneller und intensiver zu rein linuxbasierten Handies. Mögen Sie noch schneller kommen, als jetzt schon.